| UNIT | Nama Unit | Lihat |
| INSTITUT | Institut Agama Islam Negeri (IAIN) Ambon | Link |
| Fakultas | Dakwah dan Ushuluddin (FDU) | Link |
| Syariah dan Ekonomi Islam (FSEI) | Link |
| Ilmu Tarbiyah dan Keguruan (FITK) | Link |
| Program Studi | Bimbingan Konseling Islam (BKI) | Link |
| Pengembangan Masyarakat Islam (PMI) | Link |
| Jurnalistik Islam (JURIS) | Link |
| Akidah dan Filsafat Islam (AFI) | Link |
| Sosiologi Agama | Link |
| Komunikasi dan Penyiaran Islam (KPI) | Link |
| Hukum Ekonomi Syariah (HESY) | Link |
| Hukum Keluarga (HK) | Link |
| Perbandingan Madzhab (PMH) | Link |
| Hukum Pidana Islam (HPI) | Link |
| Ekonomi Syariah (EKSY) | Link |
| Manajemen Keuangan Syariah (MKS) | Link |
| Manajemen Bisnis Syariah (MBS) | Link |
| Pendidikan Agama Islam (PAI) | Link |
| Pendidikan Biologi | Link |
| Pendidikan Matematika | Link |
| Manajemen Pendidikan Islam (MPI) | Link |
| Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (PGMI) | Link |
| Tadris Ipa | Link |
| Tadris Bahasa Indonesia | Link |
| Tadris Bahasa Inggris | Link |